毎年学園内に蔓延すると言う怪談────【丑三之首】。
それは一番怖い怪談だと言われているが、誰もその正体を知る者はいない。
過去に正体を探った少女、水瀬真琴(みなせまこと)は失踪したと噂されている。

奇怪な事を研究する風変わりな少年、井丸空也(いまるくうや)は、
怪談の被害者の少女、要未希(かなめみき)の情報を元に
新たに怪談の正体に迫る。

そして今年の怪談は例年より遅れて始まった。……いないはずの水瀬真琴のメッセージとともに。